事业单位女工勤编专业技术岗位退休年龄为55岁，

针对您的问题，如果单位选择让女工勤编专业技术岗位在55岁退休，这确实有一定的法律依据。在【解答内容】中，虽然提到退休年龄取决于单位和个人的选择，但实际操作中，对于具有高级职称或专业技术人员，根据《国务院关于工人退休、退职的暂行办法》的相关规定（虽未直接提及具体条数，但隐含了灵活处理的原则），单位有权根据实际情况和工作需要，决定员工是否可以在55周岁退休。因此，单位的选择在法律框架内是受到认可的。
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如果女工勤编专业技术岗位员工希望50岁退休，单位应根据员工的个人意愿，结合单位实际情况进行处理。具体操作包括：1.与员工进行沟通，了解其退休意愿的真实性和原因；2.根据单位的人事政策和法律规定，审核员工的退休申请；3.如符合退休条件，办理相关退休手续，确保员工权益得到保障。
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从法律角度，单位在决定女工勤编专业技术岗位退休年龄时，应考虑以下因素：1.员工的个人意愿和职业规划；2.单位的工作需要和人事政策；3.相关法律法规的规定，尤其是关于退休年龄的灵活处理原则；4.确保决策过程合法、公正、透明，避免引发法律纠纷。